Anoskopija i sigmoidoskopija se koriste za evaluaciju simptoma koji se odnose na rektum i anus (npr. svježe rektalno krvarenje, krv u stolici, protruzija, bol). Osim toga, sigmoidoskopija također omogućuje biopsije tkiva kolona i primjenu intervencija kao što su hemostaza ili postavljanje intraluminalnog stenta. Nema apsolutne kontraindikacije, no treba uzeti u obzir kontraindikacije za redovite endoskopije. Bolesnicima sa srčanim aritmijama ili nedavno preboljenom ishemijom miokarda postupak bi trebalo odgoditi sve dok se komorbiditeti ne poboljšaju; u suprotnom, bolesniku će trebati pratiti rad srca. Prema smjernicama American Heart Association-a, ovi postupci ne zahtjevaju profilaksu endokarditisa.

Perianalno područne i distalni rektum se mogu pregledati anoskopom duljine 7 cm, a rektum i sigma rigidnim 25-cm ili fleksibilnim 60-cm instrumentom. Fleksibilna sigmoidoskopija je za bolesnika mnogo ugodnija pretraga i pruža mogućnost fotografskog zapisa i biopsije tkiva. Za prolazak rigidnim sigmoidoskopom dalje od rektosigmoidnog spoja (15 cm) bez izazivanja nelagode potrebna je velika vještina.

Sigmoidoskopija se radi nakon pražnjenja rektuma pomoću fosfatne klizme. IV lijekovi obično nisu potrebni. Bolesnika se postavi na lijevi bok. Nakon vanjske inspekcije i digitorektalnog pregleda, podmazani instrument se polagano uvodi 3 do 4 cm dalje od analnog sfinktera. U ovom trenutku, obturator krutog sigmoidoskopa se ukloni i instrument se umeće dublje.

Anoskopiju se može učiniti i bez prethodne pripreme. Anoskop se uvede cijelom duljinom kao što je prethodno objašnjeno za sigmoidoskopiju, obično dok je bolesnik na lijevom boku. Komplikacije anoskopije su izuzetno rijetke, kada se postupak učini ispravno.